苏联于20世纪80年代末开始进行政治改革。1990年，阿塞拜疆首次实行多党候选人选举。于1989年成立的阿塞拜疆人民阵线成为阿塞拜疆共产党有组织的反对派。阿塞拜疆人民阵线主张重建一个民主的议会制度，要求阿塞拜疆独立于莫斯科，并拥有更多的自治权，主张保留纳戈尔诺——卡拉巴赫地区，而纳戈尔诺——卡拉巴赫要求脱离阿塞拜疆共和国，于是旷日持久的武装冲突便拉开了序幕，国内各派政治力量的斗争也日趋尖锐。
权力频繁的更迭
1992年3月初，阿塞拜疆政府军在冲突中严重失利，迫使总统阿亚兹·穆塔利博夫辞职，由阿塞拜疆国民议会议长任临时总统。5月14日，阿塞拜疆最高苏维埃召开非常会议，恢复了穆塔利博夫的总统职务，并确定苏拉特·侯赛因诺夫为总理。15日，穆塔利博夫总统宣布在首都实行紧急状态。当天，人民阵线同政府的对抗即发展成武装冲突，以人民阵线为首的反对派占领了总统府后，穆塔利博夫下落不明。18日，阿塞拜疆最高苏维埃同意马梅多夫辞去最高苏维埃主席和代总统的职务。阿塞拜疆人民阵线副主席甘巴罗夫选举为最高苏维埃主席和代总统。
6月7日，阿塞拜疆举行大选，人民阵线主席阿布法兹·埃利奇别伊当选为阿塞拜疆共和国的总统。他表示：阿塞拜疆将不参加独联体。阿塞拜疆新政府将用政治的、经济的和外交的努力，而不是以军事的手段来“建设性地”解决同亚美尼亚的关系和纳戈尔诺——卡拉巴赫危机，主张积极发展同世界各国建立“平衡关系”。由于他在与俄罗斯关系中的强硬态度，纳——卡问题毫无进展，国内经济的持续恶化，当局内部出现严重政见分歧，焦点在总统与总理苏拉特·侯赛因诺夫身上。